ФГБУ «Главрыбвод» в 2017-2021 годах в рамках государственного задания выполнял целый ряд работ в рамках государственного мониторинга.
Сбор данных о гидрологическом и температурном режиме водных объектов в местах зимовки, массового нагула и миграций водных биологических ресурсов. В 2020 году количество измерений составило 8 323 штуки. На 2021 год запланировано выполнение 9 723 измерений.
Составление и обновленных карточек нерестилищ, что позволяет отслеживать заполняемость нерестилищ и эффективность естественного нереста, а также результативность работ по установке искусственных нерестилищ. В 2020 году объём выполненных работ составил 478 штук. В 2021 году запланировано 482 штуки.
Обследование особей водных биологических ресурсов на наличие меток для проведения оценки результативности искусственного воспроизводства, которая вырежется в коэффициентах промыслового возврата. Количество обследованных особей составило в 2020 году 3 250 штук. В 2021 году запланировано в тех же объёмах.
Сбор и обработка материалов для определения показателей кормовой базы водных объектов рыбохозяйственного значения, результаты которой являются основой для оценки научно-исследовательскими организациями приемных емкостей водных объектов, то есть позволяют оценить возможные объёмы выпуска личинок и молоди. Количество точек отбора проб бентоса и планктона составило в 2020 году 849 штук. На 2021 год запланировано выполнение работ на 1 005 точках забора проб.
Проведение биологического анализа водных биологических ресурсов, который выполняется в отношении отловленных из естественной среды производителей и позволяет отслеживать динамику биологических процессов в восстанавливаемых популяциях рыб. В 2020 году был выполнен биологический анализ 10 443 особей. На 2021 год запланировано выполнение 10 493 биологических анализов.
Обследование незаконно добытых уловов и незаконных орудий лова, выполняемые по запросам рыбоохраны для получения заключений квалифицированных ихтиологов ФГБУ «Главрыбвод». В 2020 году было выполнено 2 097 обследований. В 2021 году запланировано 1 651 обследование.
Разработка табличных материалов для определения категорий водных объектов рыбохозяйственного значения, которая выполняется на основе натурных обследований водоёмов и необходима для категорирования водных объектов. В 2020 году материалы были разработаны для 445 водных объектов. На 2021 год запланирована разработка материалов для 448 водных объектов.
Проведение экспертиз, и выдача заключений квалифицированными ихтиологами ФГБУ «Главрыбвод» по запросам органов рыбоохраны и МВД по вопросам в сфере компетенции ФГБУ «Главрыбвод». В 2020 году было выполнено экспертиз и выдано заключений в количестве 107 штук. В 2021 году запланировано в тех же объёмах.
Сбор сведений об антропогенном воздействии на водные биоресурсы и среду их обитания на акватории водных объектов рыбохозяйственного значения, в том числе мониторинг любительского рыболовства, позволяющий оценить уровень воздействия любительского рыболовства на состояние популяций различных видов рыб. В 2020 году сбор сведений осуществлялся на акватории в 116 450 га. В 2021 г. сбор сведений запланирован на площади 114 450 га.
С 2022 года ФГБУ «Главрыбвод» по государственному заданию будет выполняться только две работы в рамках государственного мониторинга: обследование особей водных биологических ресурсов и сбор и обработка материалов для определения показателей кормовой базы водных объектов рыбохозяйственного значения.