Рыбоводы филиала восстанавливают стерлядь донской популяции и белуги азовской популяции в Азово-Черноморском рыбохозяйственном бассейне путем искусственного воспроизводства.
Донская популяция стерляди занесена в Красную книгу Российской Федерации в 2001 году, как находящаяся под угрозой исчезновения.
Азовская белуга, в соответствии с приказом Росрыболовства от 23.10.2019 года № 596 отнесена к особо ценным водным биоресурсам (категория А — Особо ценные виды). Также в соответствии с приказом Государственного комитета РФ по охране окружающей среды от 24.03.2020 № 162, она занесена в Красную книгу Российской Федерации как вид, находящийся под угрозой исчезновения (категория статуса редкости объектов животного мира — «1»), включена в список КР — «вид, находящийся под критической угрозой исчезновения».
Белуга (Huso huso) включена в Красную книгу Международного союза охраны природы (МСОП) со статусом CR (таксоны
в критическом состоянии), принадлежит к объектам действия международных соглашений и конвенций, ратифицированных Российской Федерацией, занесена в Приложение II СИТЕС (Конвенция ООO «О международной торговле видами дикой фауны и флоры, находящимися под угрозой уничтожения»).
За период с 2018 по 2025 годы филиал выпустил в бассейн Азовского моря реки Дон, ниже Цимлянского гидроузла в границах Ростовской области более 15 млн. этих видов, а именно: 13,43 экземпляров стерляди и 1,57 млн экземпляров белуги.
